• 真核生物基因转录水平调控主要通过顺式（对同一染色体或DNA分子而言）和反式（对不同染色体和DNA分子而言）调控来调节
  • 由顺式转录元件和反式作用因子共同决定

顺式作用元件

  • 指DNA分子中具有转录调节功能的特异DNA序列，其活性仅影响与其自身处于同一条DNA分子上的基因
  • 如启动子，增强子，沉默子等

启动子

  • 核心启动子：指保证RNA聚合酶II转录正常起始所必须的、最少的DNA序列，包括转录起始点及TATA box。核心启动子单独起作用时，只能确定转录起始点并产生基础水平的转录。
  • 上游启动子元件：包括通常位于-70bp附近的CAAT盒和GC盒，能通过TFIID复合物调节转录起始频率，提高转录效率。

增强子

只能使与它连锁的基因转录频率明显增加的DNA序列

沉默子

类似于增强子但起负性调控作用的顺式作用元件。

反式作用因子

  • 通过直接或间接识别和结合顺式作用元件而调节基因转录活性的蛋白质因子。
  • 包括DNA识别或结合域、转录活化结构域。

RNA聚合酶和基本转录因子

基本转录因子

  • 是真核RNA聚合酶结合启动子所必须的一组蛋白质因子，决定3种RNA转录的类别
  • 除个别通用（TFIIB），大多数成分是不同RNA聚合酶转录所需的，比如RNA聚合酶II需要TFIID/TFIIA/TFIIB/TFIIE等
  • 基本转录因子按照特定顺序结合到启动子上，帮助RNA聚合酶特异性地结合到靶基因的启动子上，形成PIC

特异性转录因子

  • 一类与靶基因启动子、增强子或沉默子特异性结合的转录因子，具有细胞特异性
  • 转录激活因子
  • 转录抑制因子

辅助调节因子

不与DNA直接结合，而是直接或间接地与基础转录因子或特异性转录因子的蛋白亚基结合而参与基因转录调控